“以防为主，防治结合”是防治水产养殖动物疾病的基本方针。强调疾病的预防之所以对水产养殖动物特别重要，首先是因为水产养殖动物是生活在水中的，在疾病的发生初期难以被及时发现，当患病后的水产养殖动物被养殖业者发现时，往往已经是整个鱼群都已经发展到了病入膏肓的危重阶段了，此时即使采取了正确的治疗措施也可能已经为时过往，难以获得理想的疗效了。其次，因为现在的水产养殖方式大多是对水产养殖动物实施集约化养殖，而对大量的养殖动物同时给药是比较困难的，既不能做到像对待陆生饲养动物猪、牛一样逐尾口灌给药，也难以做到逐尾注射给药，患病后的水产养殖动物往往因为丧失食欲而不能摄食拌有治疗药物的饵料。其三，将拌有治疗动物疾病的药物饵料投放在养殖水体中后，没尾鱼摄入药物的剂量就只能依靠鱼体自由摄食饵料的多少决定了。通常的结果是不该摄食药物未了的健康鱼体因为食欲旺盛而摄食了大量药物饵料，而需要药物治疗的病鱼体则因为丧失了食欲反而没有摄食或摄食量过少，未能到达能治疗疾病目的的药物量。其四，采用药物治疗水产养殖动物的疾病时，难以避免因药物在水体中的扩散而导致对水体环境的污染，特别是因为我国的水产养殖水体大多是开放式的。药物污染的危害可能因为养殖用水的随意排放而造成更大的危害。其五，当水产动物患病后不仅会影响其生长，而且还会影响其商品价值。